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Olá a todos, já faz um bom tempo desde meu último post. Espero que todos tenham permanecido seguros e saudáveis ​​durante esses tempos!

Meu último post mergulhou na análise de repetição curta em tandem (STR) para monitoramento de enxerto de medula óssea. Hoje é a apresentação de um paciente que foi transplantado para tratamento de leucemia mieloide aguda (LMA). Com todos os pacientes (com pequenas exceções), as amostras do doador e do receptor pré-transplante são coletadas antes do transplante. Seus alelos informativos são então identificados e usados ​​para determinar a porcentagem de células do doador e quaisquer células receptoras em amostras pós-transplante subsequentes.

Este paciente foi o único que não conseguimos obter a amostra do doador (eles foram transplantados fora de nosso sistema) e, portanto, usamos um esfregaço bucal para seus informativos pré-transplante.

Os esfregaços bucais são escolhidos porque são uma forma não invasiva de obter células epiteliais escamosas. Essas células são importantes porque são da origem do receptor e não sofrerão alterações. Com essa técnica, é essencial que o paciente não tenha inflamação da mucosa ou não seja muito áspero ao esfregar a bochecha. Caso contrário, a amostra bucal pode ficar contaminada com sangue que conteria células de doadores.

Em seguida, inferimos os informativos do doador a partir dos dados de uma amostra mista e do esfregaço bucal.

O cálculo da porcentagem de receptor e doador em uma amostra pós-transplante é determinado em fórmulas específicas que utilizam esses alelos informativos. Mas o que acontece quando um paciente tem recaídas e novas mutações ou deleções são introduzidas em seu genoma, causando uma mudança nesses alelos informativos?

Nesse caso, a paciente apresentou perda do alelo em dois locos (CSF1PO – alelo 11 e D5S818 – alelo 13) após obtenção prévia de enxerto total (Figura 1).

Figura 1. A pré-amostra foi adquirida por meio de swab bucal. Não havia amostra de doador adquirível e, portanto, os alelos informativos do doador foram inferidos por meio dos dados disponíveis. Em setembro de 2019, o paciente estava com 100% doador. Quase um ano depois, o paciente está agora com 4% do doador e sem alelos de receptor previamente identificados, indicando uma perda de alelo / mutação. Caixa marrom com “R” significa destinatário. A caixa azul com “D1” significa doador. A caixa verde com D1R significa compartilhado.

A importância aqui é que o verdadeiro percentual doador é 4% (Figura 2). Se dermos uma olhada nos alelos informativos afetados, vemos um resultado errôneo de 100% doador e NI (o que significa que o locus não é informativo, eliminando-o dos cálculos). Isso amplia a importância de um analista estar atento aos resultados apresentados. Embora esse caso tenha sido claramente evidente e tenha sido detectado por nossas medições de erro, é teoricamente possível causar um problema, especialmente nos casos em que as porcentagens de destinatários podem ser menores. Além disso, esse fenômeno enfatiza a importância de incluir vários alelos informativos em nossa análise, o que aumenta nossa medição de confiança.1

Figura 2. CSF1PO e D5S818 estão representando incorretamente o estado do paciente. CSF1PO está representando o paciente em 100% doador e D5S818 é automaticamente identificado como não informativo pelo nosso software. Depois que os loci automáticos e manuais são ignorados, o percentual total do doador foi de 4%

Sabemos que uma perda de alelo (perda de heterozigosidade) é a explicação provável porque ambos os loci estão em locais específicos para a doença. Observando a Figura 3 abaixo, os dois alelos foram afetados porque ambos estavam presentes no braço longo do cromossomo 5. Além disso, esse cromossomo é conhecido por estar envolvido na LMA e também, é claro, está associado a outros distúrbios como SMD.2 Além disso, o paciente fez um teste de citologia que o identificou como um cromossomo afetado.

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Figura 3. CSF1PO e D5S818 estão localizados no braço longo do cromossomo 5. A localização de CSF1PO é 5q33.1 e a localização de D5S818 é 5q23.2.

Este é um fenômeno interessante e que mostra em termos mensuráveis ​​como o estado de um paciente pode afetar seus resultados moleculares. É mais uma expressão dos mecanismos moleculares de uma doença, uma das minhas primeiras experiências mensuráveis ​​de como uma doença afeta os constituintes físicos moleculares de outro ser humano.

Para mim, esse encontro foi uma expressão de quão complicado, mas conectado, todo o genoma foi projetado. Estou continuamente surpreso e espero expandir minha compreensão da ciência molecular.

Referências

  1. Crow J, Youens K, Michalowski S, et al. Leucemia de células doadoras em pacientes submetidos a transplante de sangue de cordão umbilical: um estudo de caso e revisão da literatura destacando a importância da análise do enxerto molecular. J Mol Diagn. 2010; 12 (4): 530-537. doi: 10.2353 / jmoldx.2010.090215
  2. Crow J, Youens K, Michalowski S, et al. Leucemia de células doadoras em pacientes submetidos a transplante de sangue de cordão umbilical: um estudo de caso e revisão da literatura destacando a importância da análise do enxerto molecular. J Mol Diagn. 2010; 12 (4): 530-537. doi: 10.2353 / jmoldx.2010.090215

-Ben Dahlstrom é graduado recentemente pelo programa MLS da NorthShore University HealthSystem. Ele atualmente trabalha como tecnólogo molecular para a Northwestern University em seu laboratório de transplante, realizando tipagem HLA em transplantes de medula óssea e órgãos sólidos. Seus interesses incluem microbiologia, molecular, imunologia e proibição de sanguek.

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