cupom com desconto - o melhor site de cupom de desconto cupomcomdesconto.com.br

[ad_1]

Teste de população COVID-19

Testes em toda a população para identificar infecções sintomáticas e assintomáticas podem ser uma ferramenta poderosa para controlar a disseminação da Doença por Coronvírus 2019 (COVID-19), mas a capacidade de teste global atual não permite testes generalizados de indivíduos assintomáticos. Esses testes ainda são limitados a indivíduos sintomáticos, com disponibilidade limitada para aqueles com exposição recente a uma pessoa infectada.

Devido à alta prevalência de infecções assintomáticas por COVID-19, as propostas da Fundação Rockefeller para a mitigação da doença incluem testes frequentes e generalizados na população dos Estados Unidos. Nos Estados Unidos, o teste de diagnóstico para SARS-CoV-2, o vírus causador do COVID-19, é atualmente> 2 milhões por semana. As estimativas para as necessidades de teste nos EUA para vigilância ampla da população variam de 30 a 300 milhões por semana. Para dimensionar os testes em uma ordem de magnitude, novas tecnologias e repensar os paradigmas de teste atuais são necessários. O NIH iniciou um programa de financiamento rápido para desenvolver o teste SARS-CoV-2, e essas novas tecnologias podem desempenhar um papel. No entanto, podemos conceituar amplamente os problemas-chave a serem enfrentados em testes em toda a população nos Estados Unidos. O primeiro é o teste de alta sensibilidade que identifica a infecção ativa e pode ser realizado com uma taxa de transferência massiva. A segunda é a logística de coleta de centenas de milhares de amostras para cada laboratório de teste a cada dia.

Soluções de última geração para testes COVID

As tecnologias emergentes usando o sequenciamento de próxima geração direcionado foram sugeridas como uma solução potencial para testes em toda a população. Os principais recursos incluem 1) amplificação livre de extração 2) uma amostra facilmente coletada, como saliva, 3) códigos de barras de nucleotídeos para permitir o agrupamento de amostras e 4) um número limitado de alvos (para permitir um sequenciamento mais profundo, ou seja, maior sensibilidade). A Illumina está vendendo um teste de genoma completo para SARS-CoV-2, mas isso limita o sequenciamento a 3.000 testes / execução. Outra aprovação recente para um laboratório de teste privado usa apenas um destino e pode permitir um aumento para 100.000 testes / dia. E um protocolo recente para LAMP-Seq na pré-impressão descreve como isso poderia funcionar em um esquema abaixo. Um aspecto atraente desta abordagem é o processamento descentralizado de espécimes.

30 milhões de testes / semana - Labogatório 2

Considerando que Bill Gates apoiou uma abordagem de portfólio para vacinas colocando várias apostas em diferentes processos em paralelo, uma abordagem semelhante deve ser aplicada a métodos de sequenciamento multiplexado. Duas execuções de sequenciamento podem ser realizadas em um único instrumento em um único dia, que pode processar vários milhares de amostras. No entanto, o sequenciamento não é a única etapa do sequenciamento; a preparação da biblioteca e o manuseio de amostras também levam uma quantidade significativa de tempo.

Logística de Laboratório

Essa tecnologia representaria uma expansão exponencial na capacidade de testes analíticos, mas os laboratórios clínicos exigirão um escalonamento semelhante na capacidade logística. Os maiores laboratórios clínicos do mundo processam menos de 100.000 amostras por dia. Os laboratórios clínicos têm uma longa história de automação com os primeiros sistemas robóticos de rastreamento de espécimes desenvolvidos na década de 1980. A experiência de engenharia e laboratório clínico deve, portanto, se associar para inovar em métodos para lidar com grandes volumes. Esse nível de investimento para um problema que provavelmente desaparecerá em 2 anos não é atraente para a maioria dos sistemas de saúde privados, portanto, é necessário o investimento público de vários estados em laboratórios regionais de referência.

Ainda é difícil conceber que o aumento de escala necessário no processamento de amostras possa ser alcançado dentro do período de tempo necessário, então eu também proporia uma abordagem de processamento de amostra descentralizada. Isso incluiria a autocoleção de saliva (um tipo de amostra seguro e eficaz com sensibilidade semelhante aos esfregaços nasofaríngeos), locais de entrega e processamento em locais como farmácias (> 90% dos americanos vivem a menos de 8 km de uma farmácia e podem estar autorizados a administrar testes – assim como administram vacinas). Isso introduziria problemas pré-analíticos, mas se o objetivo for frequente e com altas taxas de teste, teremos que aceitar certas perdas de sensibilidade (que atualmente é indiscutivelmente melhor do que precisa ser). Curiosamente, as preocupações pré-analíticas com a saliva não levaram à instabilidade da amostra ou degradação do RNA causando falsos negativos, como descrito em meu último post. No entanto, outros fatores podem afetar a qualidade da saliva: tabagismo, idade e fatores genéticos da relação água: proteína que afetam a viscosidade.

cupom com desconto - o melhor site de cupom de desconto cupomcomdesconto.com.br

As soluções de teste devem ser consideradas no contexto da rede de teste planejada. O tipo de amostra deve ser fácil para o paciente fornecer, processado com o equipamento de laboratório existente e obtido eletronicamente. Por exemplo, o teste COVID-19 atual é baseado em coletas de amostras que requerem um profissional de saúde envolto em equipamento de proteção individual (EPI) utilizando um dispositivo de cotonete. O teste precisa progredir para uma solução mais simples, como saliva, que pode ser coletada pelo paciente na ausência de um cotonete ou EPI. Estudos preliminares demonstraram que a saliva é um tipo de amostra comparável ao swab nasofaríngeo. A amostra de saliva ideal seria coletada em um tipo de tubo de coleta existente (por exemplo, tubos com tampa vermelha) que já são compatíveis com a automação laboratorial existente. No total, uma pessoa poderia cuspir em um tubo em casa, fazer com que o tubo fosse enviado a um laboratório e, no laboratório, o tubo seria colocado diretamente em um sistema automatizado de rastreamento robótico.

Os profissionais de laboratório precisam fornecer um plano abrangente para redes de laboratórios regionais e nacionais que possam ser dimensionadas para fornecer força esmagadora aos testes COVID-19. Nenhuma outra profissão ou organização governamental entende o teste tanto quanto nós. Nossa compreensão do gerenciamento de amostras da coleta ao resultado deve ser aplicada à pandemia em questão. Até agora, a maioria dos laboratoristas nos EUA tem se concentrado nas necessidades imediatas de fornecer testes para pacientes sintomáticos e profissionais de saúde.

Visão para teste COVID-19 automatizado

Pode-se imaginar uma linha automatizada de teste que move as amostras através do processamento para permitir a multiplexação e combinações de amostras para permitir que um grande número de pacientes sejam testados de uma vez (veja abaixo). Isso é viável em alguns centros especializados, mas exigiria investimentos em automação, bioinformática e interfaces para um processo contínuo (figura abaixo). Se o teste for feito principalmente em pacientes assintomáticos, também pode ser possível fazer isso em amostras agrupadas. O número de amostras para agrupar dependeria da probabilidade de ter um resultado positivo (isso exigiria o sequenciamento de todos os indivíduos em um agrupamento).

30 milhões de testes / semana - Labogatório 3

Isso representa uma síntese de ideias em coleta descentralizada de espécimes, automação de laboratório e processamento massivo de testes com sequenciamento de última geração, mas infelizmente isso ainda não é uma realidade.

Referências

  1. Jonathan L. Schmid-Burgk et al. LAMP-Seq: Population-Sclae COVID-19 Diagnostics Using Combinatorial Barcoding. bioRxiv 2020.04.06.025635.
  2. A Fundação Rockefeller. Plano de ação de teste nacional da Covid-19 Etapas pragmáticas para reabrir nossos locais de trabalho e nossas comunidades. 2020.
  3. Cahill TJ, Cravatt B, Goldman LR, Iwasaki A, Kemp RS, Lin MZ et al. Cientistas devem parar o COVID-19. OR Rob Copeland, Wall Street Journal (2020) O Grupo Secreto de Cientistas e Bilionários Empurrando um Projeto de Manhattan para Covid-19. 27 de abril
  4. https://www.illumina.com/products/by-type/ivd-products/covidseq.html
30 milhões de testes / semana - Labogatório 4

-Jeff SoRelle, MD é um Residente Chefe de Patologia na University of Texas Southwestern Medical Center em Dallas, TX. Seus interesses de pesquisa clínica incluem entender como o laboratório se cruza com a saúde para transgêneros e melhorar a interpretação de variantes genéticas.

[ad_2]

cupom com desconto - o melhor site de cupom de desconto cupomcomdesconto.com.br

Deixe um comentário

O seu endereço de e-mail não será publicado. Campos obrigatórios são marcados com *